尹峰整整一年在了军队中，和新招收的人战士们同吃同住，忙着整编中华军。。现在的中华军已经开始形成自己的完整参谋体系、军官团、军事教育体系、后勤供应体系等。赵铁的第一团、麦德的第二团、李星的第三团、赵宣明的第四团、颜思齐的第五团作为中华军步兵野战主力开始在吕原轮流进行多兵种联合演习，最多一次集中了四个团的主力，初步开始试探把部队作战编制向师一级发展。
同时，李魁奇炮兵团、安得烈的骑兵团，鲁大海的后勤部队都开始加入到了多兵种联合军事演习的过程中。尹峰自己也是没有察觉，他的努力已经使自己的军队在技术、战术水平快速超越了欧洲列强和周围所有国家的武装力量。
水军舰队的操练也开始从支援陆军的角色向独立作战方向发展。鹿儿岛平原之战时，水手火枪队和中华军步兵的配合出现了重大纰漏，差一点使得战场形势转变。事后，尹峰在军校召开了解几次检讨会，大家一致认为，这是由于水手火枪队平日的训练和作战要求和步兵完全不一样所导致，而且水手们和步兵兄弟平时缺乏互相之间配合作战的练习，也是重要原因。
因此，尹峰参考后世海军陆战队和欧洲列强殖民地驻防分队的经验，把水手火枪队完全当作了海机动兵力来使用：南洋地方中华公司属地经常发生的土著骚乱，以后就由海机动能力强的水手火枪队来负责平定，让水手们在小规模激烈战斗中发挥机动性和灵活性；各地剿灭海盗的活将全由水手火枪队来完成，中华军的步兵职能将向专门进行大规模陆战阵战发展。各殖民地驻防队的任务也将全部转由水手火枪队来担任。当然，水手火枪队和舰队也要参加大规模战役，担任战略战术任务，不过，在尹峰想来，短时间内，中华军还不会发起大规模的战略性的进攻战争。
水军舰队的海战训练则已经被尹峰逼着大跃进到了另一时空的纳尔逊时代。这一方面是尹峰作为穿越者的先知先觉所发挥的作用，同时也是这些年中华军大炮巨舰主义表现出巨大影响力之后，水军一些将领主动思考研究后的结果。
尹峰在万历四十年1612年正式在水军内部发布了《作战条例》，这条例体现了尹峰对海战战术的超前理解的结果。中华军从此以后特别重视对于敌人战舰船体的攻击，目的在于摧毁敌舰的航行能力，并最终使其船体破损沉没。而当时各国海军依旧在海战中重视对于敌舰帆桅的攻击，目的在于杀伤对方舱面人员和降低其机动能力，最终通过跳帮夺取对方战舰。
尹峰特别
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